一是国家层面的职业资格认证，二是地方或行业层面的技能等级认定。

1、国家职业资格认证：

国家对于从事中医按摩师这一职业的从业人员有着严格的职业资格要求和考核标准，这些要求通常由国家卫生健康委员会（原卫生部）及其下属的职业资格认证中心负责实施，考取中医按摩师职业资格证书，需要通过国家统一的考试，并取得相应的职业资格证书。

2019年之后，国家取消了部分职业资格认证，但中医按摩师作为传统医疗技术的一部分，依然保留有相关的职业资格认证体系，在广东省，中医按摩师可以报考“广东省中医师承及中医按摩师”职业技能鉴定，这属于国家职业资格体系中的一种。

2、地方或行业技能等级认定：

除了国家层面的职业资格认证外，许多地方政府也设立了自己的技能等级认定系统，以便于对中医按摩师的技能水平进行评估和认证，这些地方性的认定通常由当地的卫生部门、人力资源和社会保障局或者行业协会等机构负责。

在中国的一些省份，如江苏省、浙江省等地，中医按摩师可以参加当地人力资源和社会保障局或中医药管理部门组织的职业技能等级考试，获得相应的技能等级证书，这些技能等级证书虽然不是国家认可的职业资格证书，但在行业内具有一定的认可度和权威性。

3、综合考量：

选择哪个部门颁发的中医按摩师证好，主要取决于个人的需求、所在地区的规定以及个人的职业规划。

- 如果希望在全国范围内得到认可，且不特别关注地方政策差异，可以选择国家卫生健康委员会或其下设的职业资格认证中心颁发的证书。

- 如果更看重地方政策和行业认可度，可以考虑参加地方人社局或中医药管理部门组织的职业技能等级考试，获取地方性技能等级证书。

- 对于一些特定的医疗机构或专业领域，可能还需要通过该机构内部的特殊培训和考核程序来获得从业资格。

在选择中医按摩师证的发放机构时，应当综合考虑个人的职业发展目标、所在地区的具体要求以及行业的认可度等因素，由于不同国家和地区的政策和规定可能存在差异，建议咨询当地的相关专业人士或机构以获取最准确的信息。